建立有效的跨部门合作的绩效评估体系是提高组织绩效和促进跨部门合作的重要一环。下面是一些步骤和方法，可以帮助管理者建立这样的评估体系：
1.明确目标和期望：首先，明确跨部门合作的目标和期望。这可以是共同完成某个项目、提高跨部门沟通和协作、优化业务流程等。明确目标和期望可以帮助团队明确方向，更好地协作。
2.确定关键绩效指标：根据跨部门合作的目标，确定关键的绩效指标。这些指标应该能够量化和评估团队的合作成果和贡献。例如，可以考虑指标如项目完成时间、质量指标、成本控制等。确保这些指标能够客观地反映合作绩效。
3.制定评估方法和标准：选择合适的评估方法和标准，以评估团队的合作绩效。可以采用360度评估、自评、上级评估等方式，综合考虑不同角度的评估结果。同时，为每个指标设定评估标准，明确各个绩效等级的要求。
4.收集数据和反馈：收集团队的合作绩效数据，可以通过问卷调查、项目数据统计等方式进行。同时，及时向团队和个人提供反馈，让他们了解自己的绩效表现和改进的空间。反馈应该是及时的、具体的和建设性的，帮助团队不断提高。
5.奖励和激励机制：建立奖励和激励机制，以激励团队的合作和贡献。奖励可以是物质奖励，如奖金、晋升等；也可以是非物质奖励，如表彰、荣誉等。同时，确保奖励公平公正，避免激励机制带来的不良竞争和合作破裂。
6.持续改进和学习：建立绩效评估体系是一个持续的过程。管理者应该定期评估和反思评估体系的有效性，根据实际情况进行调整和改进。同时，鼓励团队成员学习和分享跨部门合作的经验和最佳实践，不断提升合作能力。
总之，建立有效的跨部门合作的绩效评估体系需要明确目标、确定关键绩效指标、制定评估方法和标准、收集数据和反馈、建立奖励和激励机制，并持续改进和学习。这样的评估体系可以帮助管理者评估和奖励合作成果和贡献，促进跨部门合作的发展。